Государственный природный заказник федерального подчинения "Куноватский" создан 29 апреля 1985 года Приказом Главохоты № 208 (Решение Тюменского облисполкома № 371 от 27 декабря 1984 года).

Заказник расположен в пойме рек Обь и Малая Обь, а также в бассейне правого притока Оби - р. Куноват, на территории Шурышкарского района Ямало-Ненецкого автономного округа (Тюменская область).

Заказник организован в целях улучшения охраны природы и воспроизводства охотничьих животных, сохранения гнездовий и местообитаний редчайшего представителя фауны СССР - стерха, включенного в Красную Книгу МСОП, СССР и РФ, охраны типичных северотаёжных комплексов севера Западной Сибири.
К объектам охраны относятся: лисица, заяц, белка, лось, ондатра, выдра, горностай, росомаха, соболь, бурый медведь, норка; стерх, малый лебедь, сокол-сапсан, орлан белохвост, краснозобая казарка, беркут, скопа, тетерев, гусь, серый журавль, глухарь, гоголь, хохлатая чернеть; осётр, стерлядь, а также экосистемы северотаёжной подзоны тайги.

Заказник состоит из двух участков - Куноватского (147 000 га) и Большеобского (73 000 га).
Общая площадь заказника - 220 000 га.

Заказник граничит с землями сельскохозяйственного назначения (оленьи пастбища), водного фонда, Госземзапаса и лесного фонда.

Территория заказника включена в список водно-болотых угодий межународного значения ( "Нижнее Двуобье", Рамсарская конвенция)

На территории заказника проводятся работы по восстановлению северо-западной популяции сибирского белого журавля (Международный фонд охраны редких видов журавлей, программа "Стерх").

Негативное воздействие на природные комплексы заказника оказывают несанкционированный проезд транспорта, браконьерство, варварская самовольная заготовкаа леса.